Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LHX9Q9NQ69 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LHX9Q9NQ69 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms