Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC17Q9NP64 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms