Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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