Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFDQ9GZP0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFDQ9GZP0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms