Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms