Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms