Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms