Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms