Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms