Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBBP8Q99708 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP8Q99708 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms