Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms