Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms