Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms