Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms