Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms