Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD4Q96M96 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms