Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCPIP1Q96JH7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms