Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms