Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAMP4Q969E2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms