Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APCDD1LQ8NCL9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APCDD1LQ8NCL9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms