Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHST4Q8NCG5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms