Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACBD4Q8NC06 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms