Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSGALNACT2Q8N6G5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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