Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF444Q8N0Y2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms