Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
STRCQ7RTU9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms