Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR3Q6ZT12 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms