Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CAPN12Q6ZSI9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms