Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C3orf33Q6P1S2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C3orf33Q6P1S2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms