Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDE2Q6IQ49 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms