Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLX4IPQ5VYV7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms