Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF6Q5VXH4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms