Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GKAP1Q5VSY0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms