Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATAD3BQ5T9A4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms