Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms