Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX4Q5JUW0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms