Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF2Q5BJF6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms