Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3KQ59H18 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3KQ59H18 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms