Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDK2Q58EX2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms