Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms