Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms