Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP21-3Q3LHN1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP21-3Q3LHN1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP21-3Q3LHN1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP21-3Q3LHN1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP21-3Q3LHN1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP21-3Q3LHN1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP21-3Q3LHN1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP21-3Q3LHN1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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