Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LETM2Q2VYF4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LETM2Q2VYF4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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