Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms