Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA6Q15825 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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