Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIX1Q15475 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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