Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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NCF4Q15080 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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NCF4Q15080 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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