Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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BRD3Q15059 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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