Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM1Q15032 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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