Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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HERPUD1Q15011 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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