Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GAPVD1Q14C86 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
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